支持向量機(jī)集成的人類基因啟動子識別
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標(biāo)簽：向量機(jī)(20755)識別(31879)
為高效地判別人類基因啟動子，提出了一種基于單核苷酸統(tǒng)計和支持向量機(jī)集成的人類基因啟動子識別算法。首先通過基因單核苷酸統(tǒng)計，從而將一個基因數(shù)據(jù)集分為C偏好和G偏好兩個子集；然后分別對這兩個子集提取DNA剛性特征、詞頻統(tǒng)計特征和cpc島特征；最后采用多個支持向量機(jī)（SVM）集成的方式來學(xué)習(xí)這三種特征，并討論了三種集成方式，包括單層SVM集成、雙層SVM集成和級聯(lián)SVM集成。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明所提算法能夠提高人類基因啟動子識別的敏感性和特異性，其中雙層SVM集成的敏感性達(dá)到79. 51%，且級聯(lián)SVM集成的特異性高達(dá)84. 58%。
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